香港特区政府4月18日宣布将对印度、巴基斯坦及菲律宾实施地区性航班熔断机制，从4月20日0时起禁止所有从上述地区来港的民航客机着陆香港，为期14天。同时，将这些地区列为《预防及控制疾病(规管跨境交通工具及到港者)规例》(第599H章)下的极高风险A组指明地区，限制曾在这些地区逗留人士登机来港。
特区政府在4月14日开始实施经收紧的个别航班熔断机制，并同时实施新设并行的地区性航班熔断机制。在地区性航班熔断机制下，从同一地区抵港的所有民航客机，不论任何航空公司，如在7天内共有5名或以上乘客经抵港检测确诊并带有N501Y变种病毒株，政府将引用第599H章禁止所有从该地区来港的民航客机着陆香港14天，同时亦会将相关地区列为第599H章下的极高风险地区，禁止曾逗留于该地区超过两小时的人士登上任何来港的民航客机，为期14天，以避免相关地区人士经转机到港。
特区政府发言人表示，由于香港首次在社区发现涉及新冠病毒N501Y变种病毒株的确诊病例，为审慎起见，特区政府按刚落实的地区性航班熔断机制所设的指标，追溯过去14天从不同地区经抵港检测而确诊带有N501Y变种病毒株的输入个案。印度、巴基斯坦及菲律宾均涉曾经在过去14天期间有累计7天相关个案数目触及相关指标，因此政府将对这三个地区实施地区性熔断机制。
